蒋介石于九江失守当天（7月6日），分别致电第五战区白崇禧和第九战区陈诚。
致白崇禧电报内容是：“（1）敌已于5日陷九江及池口，有沿长江两岸突进之企图。（）广济阵地与田家镇要塞相联系，极为重要，应置重于该地，集结兵力，纵深配备。（）太湖、宿松、黄梅据，仅以必要各一部守备，为攻势的支撑即可，应以主力机动使用，由北方向南侧击敌人。（4）刘汝明两师分散于黄梅、宿松、广济广大地域，处处薄弱，殊感危险，希适当集结使用于广济阵地为盼。（5）广济以东山地万一发生破绽，亦无关系，惟广济阵地必须固守。”
致陈诚电报内容是：“决在德安、瑞昌一带与敌决战，但张家山阵地须固守，掩护大军开进。”并对薛岳和张发奎两兵团的兵力部署作了具体安排。
7月1日，军委会调张发奎去武汉受审，电令“南浔方面自即日起由薛（岳）吴（奇伟）两总司令负责”，从此南浔路方面即归第1兵团总司令薛岳指挥。因日军航空兵基地和前进机场已接近武汉，大批敌机多次轰炸武汉（仅7月19日一天，武汉民众就伤亡一千余人），而且武汉大战迫在眉睫，于是国民党中央委员会于8月1日明令：中央党部及政府各院、部、会驻武汉办事处，限期迁往重庆。8月日，武汉卫戍总司令部政治部又发表文告，劝导武汉民众疏散，撤离三镇。
第九战区当时判断：日军将以一部兵力对南浔路方面采取攻势，以主力由九江向瑞昌方面采取攻势，目的在于侵占瑞昌、田家镇、富池口沿江要地，在海、空军配合下溯江西进，直取武汉。因而决定以一部兵力配置沿江各要及南浔路，主力控置于德安、瑞昌以西及南昌附近地区，从侧翼攻击深入日军。以第1兵团担任南浔路正面防御，屏障南昌，侧击西进日军；第兵团担任瑞昌一带作战任务，保卫武汉，并掩护南浔正面的左侧翼。据此，8月5日拟订了《第九战区武汉会战作战计划》。
8月6日，****主席**及中央总书记张闻天等，致电在武汉的周恩来、叶剑英等**代表，指出有关保卫武汉的方针。
电文：“保卫武汉，重在发动民众，军事则重在袭击敌人侧后，迟滞敌进，争取时间，务须避免不利的决战，至事实上不可守时，不惜断然放弃之。因目前许多军队的战斗力远不如前，若再损失过大，将增加各将领对蒋（介石）之不满，投降派与割据派起而乘之，有影响蒋的地位及继续抗战之虞。在抗战过程中巩固蒋之地位，坚持抗战，坚决打击投降派，应是我们的总方针。而军队力量之保存，是执行此方针之基础。”
周恩来等据此向蒋介石等军委会主要领导人，提出了保卫武汉的建议。
8月日，军委会得到上海发来的情报，知日军第11军主力将在攻占瑞昌后溯江西进，并将经阳新进攻咸宁；其海军将竭力打通武穴方面水路，以掩护其陆军在武穴南北岸登陆。
8月4日，瑞昌失陷。军委会根据当时具体情况，决定令第一线部队竭力迟滞当面日军；自后方调集重兵至鄂南地区，以增强该方面战斗力，实施纵深配备，阻遏日军攻势。据此拟订了《保卫武汉作战计划》。
日军攻占瑞昌后，战斗已发展到武汉核心地区，但日本海军溯江西进部队，因受沿岸炮火袭击和江上水雷困扰，进展极为缓慢。军委会根据当时战局，于9月上旬，拟订了《武汉会战方针目的及策略指导》，经蒋介石批准后，作为今后指导武汉会战的基本准则。