历史上关于荀彧的评价因为其最终劝阻曹操封公，所以是有着很大的争议，在《三国志·注》和《资治通鉴》里裴松之和司马光都对于荀彧做出了自己的评价。
【荀彧之评】
据《献帝春秋》记载：董承之诛，伏后与父完书，言司空杀董承，帝方为报怨。完得书以示彧，彧恶之，久隐而不言。完以示妻弟樊普，普封以呈太祖，太祖阴为之备。彧后恐事觉，欲自发之，因求使至鄴，劝太祖以女配帝。太祖曰：“今朝廷有伏后，吾女何得以配上，吾以微功见录，位为宰相，岂复赖女宠乎！”彧曰：“伏后无子，性又凶邪，往常与父书，言辞丑恶，可因此废也。”太祖曰：“卿昔何不道之？”彧阳惊曰：“昔已尝为公言也。”太祖曰：“此岂事而吾忘之！”彧又惊曰：“诚未语公邪！昔公在官渡与袁绍相持，恐增内顾之念，故不言尔。”太祖曰：“官渡事后何以不言？”彧无对，谢阙而已。太祖以此恨彧，而外含容之，故世莫得知。至董昭建立魏公之议，彧意不同，欲言之於太祖。及赍玺书犒军，饮飨礼毕，彧留请间。太祖知彧欲言封事，揖而遣之，彧遂不得言。彧卒於寿春，寿春亡者告孙权，言太祖使彧杀伏后，彧不从，故自杀。权以露布於蜀，刘备闻之，曰：“老贼不死，祸乱未已。”
然而后世裴松之对于这里一些言论却颇有争议，他认为袁晔在《献帝春秋》里关于荀彧的记载不真实，其具体记载为：
臣松之案献帝春秋云彧欲发伏后事而求使至鄴，而方诬太祖云“昔已尝言”。言既无徵，回讬以官渡之虞，俯仰之间，辞情顿屈，虽在庸人，犹不至此，何以玷累贤哲哉！凡诸云云，皆出自鄙俚，可谓以吾侪之言而厚诬君子者矣。袁晔虚罔之类，此最为甚也。
陈寿给荀彧的最终评价是：荀彧清秀通雅，有王佐之风，然机鉴先识，未能充其志也。
这里裴松之也给出了自己的看法：世之论者，多讥彧协规魏氏，以倾汉祚；君臣易位，实彧之由。虽晚节立异，无救运移；功既巍俊远ァ俊缘恪俊孕 俊运担琺.↗.co√澹兑嗑窝伞３率洗似溃且嗤跏朗丁３妓芍晕寡灾鳎衔吹闷湓洞笳咭病癫恢何渲酒撬ズ褐瓿荚眨苛家杂谑蓖醯兰任ⅲ崃饕鸭酆阑⑹樱嘶骋煨模挥胁β抑剩趟持裕蚝菏抑龊鲋睿字嚅逡印７蛴碓奘庇ⅲ豢锿驮耍撬谷酥攵朐眨渴枪示诩辈。艟壬硎祝媚芏趲M中，至于大亨，苍生蒙舟航之接，刘宗延二纪之祚，岂非荀生之本图，仁恕之远致乎？及至霸业既隆，翦汉迹著，然后亡身殉节，以申素情，全大正於当年，布诚心於百代，可谓任重道远，志行义立。谓之未充，其殆诬欤！
从中我们可以看出裴松之对于荀彧还是颇为推崇的，无独有尔，后世另外一位大历史学家司马光在《资治通鉴》中也是对于荀彧赞美有加。
司马光认为：“孔子对于评价仁德是非常重视的。即使是子路、冉求、公西赤这些杰出的门人，令尹子文、陈文子这些诸侯的贤能大夫，都不够资格，而唯独称赞管仲的仁德，岂不是因为他辅佐齐桓公，对百姓有很大的恩德吗？齐桓公的行为像猪狗一样，但管仲并不以为羞耻而辅佐他，是因为他知道，没有齐桓公，百姓就不能得到拯救。汉末天下大乱，百姓灾难深重，假如没有绝的才能，便不能拯救百姓。既然这样，那么荀彧舍弃曹操，还能去辅佐谁呢？
齐桓公的时代，周期王室虽已衰败，但还没有像建安初期的汉朝王室那样。建安初期，全国大乱，汉朝朝廷连一尺土地、一个百姓都没有。荀彧辅佐曹操而使他兴起，推荐任用贤能的人才，训练军队，裁决机要，制定策略，征伐四方，连续获胜。于是转弱为强，化乱为治，占有了天下的十分之八，荀彧的功劳难道还不如管仲吗！管仲没有为子纠而死，但荀彧却为汉朝王室而死，他的仁德又在管仲之上了！”
可是，杜牧却认为：“荀彧在劝曹操攻取兖州时，把他比作高祖刘邦与光武帝刘秀；在官渡之战时不让曹操撤退回许都，则比作楚汉相争。等到大事已经完成，荀才想在汉代留下尽忠的声名。这就好比教偷去挖墙破柜而不与偷分赃，能他不是偷吗？”臣认为，孔子：“文胜质则史。”所有撰写历史的人，在记载历史人物的言语时，都会加以修饰。那么，把曹操比作刘邦、刘秀以及楚汉相争等，只是史学家的文字，怎么会都是荀彧所的话呢！根据这些话来贬低荀彧，是冤枉人。而且，假使曹操称帝，那么荀彧将成为最大的开国功臣，会受到与萧何一样的赏赐。荀彧不贪图这样的富贵，而牺牲生命换取的名声，难道是人之常情吗！”
【荀彧之惑】
不管裴松之和司马光对于荀彧多么推崇，但有一不可否认，荀彧是选择了帮助汉室天子，并且最终站在了曹操的对立面，在这种情况下曹操不恋旧情选择除去荀彧是无可厚非的。
然而荀彧这么做是非常令人疑惑的，荀彧和其他人不一样，他是从曹操占据东郡开始就一直追随曹操的元老级人物，并且可以是曹魏的奠基者之一，他的地位在曹魏集团中长时间以来可以就仅次于曹操一人而已，从这个层面上来荀彧没有任何理由站在曹操的对立面，曹操被封为魏公，荀彧反而应该由衷的高兴才对的。
而以荀彧的才能，他也不可能不知道汉室衰落已经成为定局，曹操封公，封王也是大势所趋，然而荀彧却选择背道而驰，和大势所对抗，因此得罪了曹操，最终一命呜呼。
那到底是什么原因让荀彧对于大汉对于献帝忠心到这个地步呢？
我个人认为这个问题就出在“居中持重”上面，曹操在迁都许昌后，经常在外面领兵作战，其内部的政务和朝廷的管理就都交给了荀彧，而这一恰恰导致了荀彧和天子汉献帝长时间的接触，因为当时荀彧是曹操的代言人，而献帝则是国家名义上的领导者，他们之间必然会有沟通的。
而这个时间有多长呢？从建安元年（196）开始，一直到建安十七年（1）荀彧去世，他和献帝在一起待了快二十年，这么长的时间下来献帝对于荀彧怎么可能没有影响，由于和天子的朝夕相处，使得荀彧对于天子产生了同情心里，这在对外方面没有问题，但在对内上面，荀彧就可能无法做到以曹操的利益为最优先了。
最终在曹操对于皇权产生直接威胁之时，荀彧被迫和曹操决裂，这无论对于曹操而言，还是对于荀彧而言，都是一个悲剧。