第一天
几天前，在学园都市里，经过御坂美琴的数次请求，玄武终于答应她帮忙寻找御坂妹妹的灵魂，很快，他就找到了，“她们的魂魄就在学园都市里，并没有离去。今天晚上十二我便可以让你见他们。”
当天晚上，御坂美琴翻墙逃出宿舍，找到，后者给了她一柱香，郑重嘱咐道:“人有人界，鬼有鬼界，现在我用离魂之法让你的魂魄脱离身躯，使你可以与鬼魂相见，为了保险，这次时间应在一柱香之内。”
淡白色的光芒生成，照在御坂美琴身上，她顿时感到一种短暂的昏昏欲睡的感觉，眼皮沉重，她慢慢地软倒在地。接着，身体一轻，她又清醒过来，另一个“自己”正躺在地上。玄武交给她一支已经燃的线香，“你拿着，它能感格鬼神，护你三魂，保你七魄。当它燃时，你便会回来。”
闻着淡淡的香气，御坂美琴把线香接过，走进了白光之中。如同从水下越出水面的感觉过后，她来到了一个完全陌生的地方。
天空依然是漆黑的，但十分明净、十分纯粹，没有学园都市那种被光污染的感觉。周围的景观完全变了，没有生硬密集的水泥高楼，宽阔的草地上和树林边，是较为低矮的三五层木屋，淡黄色的温馨灯光和不时的笑声从里面散出来。更远的远方是连绵不绝的低矮丘陵，它们在夜色中静静地伏着。
是在乡村吗？御坂美琴向前走了一步，旁边草丛里的虫子受到惊吓，立刻停止了鸣叫。凉风吹来，线香的烟雾随之晃动，眼前一花，她又来到了一处有些熟悉感的现代建筑中间。
街道一个行人都没有，两边是各式的商店，商店里也没有任何的人，这里俨然是一个空城。
“姐姐大人？御坂998号又高兴又伤心地问道。”
身后传来的声音让御坂美琴浑身一震，她的心跳加速了。转过身去，她看到了一个御坂妹妹正手拿一只雪糕，头微微歪着，瞳孔依然无光，但面上却已有了疑惑的表情，“姐姐大人？御坂998∏□∏□∏□∏□，∨.c↑o再一次问话。”
激动、怀疑、欣喜、悲伤……种种情绪同时在心里聚集。面前的御坂妹妹是真的吗？御坂美琴在心里这样问自己，但当她的目光向下，落在御坂妹妹别在胸前的青色“蛙太”徽章时，令人心酸和悲伤的回忆涌上心头，化作泪水，从眼里流了岀来。她想起了和御坂998号度过的那个美好的下午。
这个蛙太徽章是御坂998从她手中“抢去”的，在被一方通行撕下一条腿，用一辆车砸下时，她还紧紧抓着，并把它视为姐姐送给自己的个人礼物。
脸上传到轻轻的触感，御坂998用手背轻轻擦拭着御坂美琴的泪水，“姐姐大人你为什么流泪？是因为死亡吗？死亡是每一个人都不可避免的，御坂998号心地道。”
“不是，我并没有死去，我只是暂时地来到这里”，御坂美琴摇摇头，抹了抹脸上的泪水，“我流下泪水，是因为再次见到你，这是喜悦的泪水。”
“原来是这样，御坂998号松了一口气。”
“只有……只有你一个人吗？”
御坂妹妹把剩下的半只雪糕一口吞了下去，“不是的，御坂们住在一个很大很大的宿舍里面，御坂998号只是感到肚子饿了才走到街上。”
御坂美琴吸了口气，仿佛是想宣告自己已经做好了面对“已经死去”的妹妹们的准备，“带我去看看她们吧。”
“面对姐姐大人的要求，御坂998头表示答应，但是脸上又露岀一不满，因为经过观察，姐姐大人并没有带礼物。”
“……还是，还是那个性格啊……”
漫步在无人的街道，御坂美琴一边走一边向御坂998询问，对这个地方有了一个初步的了解。
人们喜欢把这里称为“幻想都市”，或者是“灵魂场”，意为“幻想中的学园都市”和“灵魂聚集的地方”。
第一个来到这里的人是谁，已经不知道了，但据第一批到达这里的灵魂回忆，他们来到幻想都市，是在二十年前。当时这里白茫茫一片，什么都没有。
知道这个世界与生前的世界相互隔绝，再无回去的可能，人们怀着不同的心情，以不同的方式开始了他们的另一段生命。
在科学家们开发超能力的实验中丧失生命的孩子们终于脱离了实验室，哭泣之后，整天玩耍，无所事事；被抢劫犯杀死的青年终日游荡，等待着杀死自己的那个人；因公殉职的警备员受到了人们的尊敬；在医院中逝世的老人聚集在一起，谈论人生；为情所困而自杀的少女得到了开导，知道了生命的可贵……在灵魂场中，在不同的人意识的作用下，不同的景观和建筑渐渐生成。
幻想都市是大家一起建造的。
奇怪的是，孩子们没有遇到害死他们的科学家，被抢劫犯杀死的青年没有等到那个抢劫犯……好像有些人，不会来到这里。
御坂美琴手中的线香燃去了三分之二后，她和御坂998号来到到一间高大宽阔而且明亮的建筑物前。她依稀认得这是一间曾被她破坏掉的制造御坂妹妹的研究所。
听到她的疑问后，御坂998号歪了歪头，“御坂们没有住过别的地方，对研究所最熟悉，就是这样了。”
御坂美琴心中不由一酸，她转过脸去，指着大楼边的一块一个人高的石头，问:“这个也是你们制造岀来的吗？我发现附近有很多这种东西。”
“它们本来就在了，御坂998回答道。”
走进建筑物时，另一边传来阵阵激动人心的音乐，御坂美琴不由得停了下来，仔细倾听。这个节奏，好像在哪里听过？
“声音又响起来了，它们和那些石头一样，不知在什么时候就在都市里面。御坂998耐心地向姐姐大人解释。”
御坂美琴突然想起来了，这就是大力在飞机上曾经哼过的《only——railgun》！